KURSLAR

3 Boyutlu Kalem ile 3 Boyutlu Anatomik Modellerin Tasarımı

Kurs Tarihi: 18 Eylül 2024
Kurs Saati: 09:00 – 11:00
Kurs Ücreti: 1.500 TL
Kurs Yeri: İstanbul Medeniyet Üniversitesi, Kuzey Yerleşkesi, Tıp Fakültesi Dekanlık Binası Anatomi Anabilim Dalı Laboratuvarı
Katılım 15 kişilik kontenjan ile sınırlıdır.
Kurs katılımcılarının kursa kayıt olabilmesi için kongre kayıtlarını tamamlamaları gerekmektedir.

Kurs Eğitmeni: Dr. Öğr. Üyesi Gkionoul Nteli Chatzioglou

Kursun Amacı ve Özeti

Etkinliğin amacı, kurs/atölye katılımcılarının Üç Boyutlu (3B) kalem kullanarak anatomik modeller tasarlamasını sağlamaktır. Bu kurs, katılımcılara, öğrencileri için etkili ve maliyeti düşük anatomik modeller geliştirme ve 3B kalem kullanma becerilerini kazandırmayı amaçlarken, aynı zamanda bu alandaki yenilikçi yaklaşımları teşvik etmeyi hedeflemektedir.

Geliştirilen anatomik modeller, eğitim materyali olarak kullanılabilecek ve anatomi derslerinde öğrencilerin daha etkili bir şekilde öğrenmelerini ve konuyu daha derinlemesine anlamalarını sağlayacak alternatif bir eğitim materyali oluşturacaktır. Ayrıca, bu etkinlik, katılımcıların yaratıcılıklarını ve pratik becerilerini geliştirmelerine yardımcı olacak ve böylece mesleki gelişimlerine katkıda bulunacaktır.
Bu amaçlar doğrultusunda, etkinliğin planlanması ve uygulanması, katılımcıların hem teorik bilgilerini hem de uygulamalı becerilerini geliştirmelerine yönelik bir fırsat sunacaktır.

Kurs Formatı

Uygulamalı kurs, toplam 2 saat sürecek şekilde, 1 saat teorik ve 1 saat uygulama olarak planlanmıştır. Kursun sonunda, katılımcılar tarafından tasarlanan modeller kendilerine hediye edilecektir.
Kursun Detayları: Vesica biliaris (fellae) ve ductus choledocus’un varyasyonları tasarlanacaktır. Her katılımcı farklı bir varyasyonu modelleyecektir.
Teorik ders: Teorik derste 3B kalemin kullanımı ve kullanım esnasında dikkat edilmesi gereken hususlar vurgulanacaktır.
Uygulamalı Ders: Uygulamalı derste katılımcı öncelikle 3B kalem ile iki boyutlu safra ve kanallarını inşa edecektir. Sonrasında ise bunları 3 boyutlu nesnelere dönüştürecektir.

*Kursu başarı ile tamamlayan kursiyerler kurs katılım belgesi almaya hak kazanacaklardır.

 

Beyin MR T1 Görüntülerde Volbrain/HIPS Kullanılarak Hipokampüs Kısımlarının Segmentasyonunu Yapma Ve Itksnap ile Üç Boyutlu Modelleme

Kurs Tarihi: 18 Eylül 2024
Kurs Saati: 13:00 – 17:00
Kurs Ücreti: 1.500 TL
Kurs Yeri: İstanbul Medeniyet Üniversitesi, Kuzey Yerleşkesi, Tıp Fakültesi Dekanlık Binası Anatomi Anabilim Dalı Laboratuvarı
Katılım 15 kişilik kontenjan ile sınırlıdır.
Kurs katılımcılarının kursa kayıt olabilmesi için kongre kayıtlarını tamamlamaları gerekmektedir.

Kurs Eğitmenleri: Prof. Dr. Niyazi Acer ve Dr. Öğrt. Üyesi Sefa Işıklar

Kursun Amacı ve Özeti:

MR T1 görüntüleme klinikte rutin olarak yapılmaktadır. Bu çekimlerin bazıları ise volumetrik olup değişik sekanslarda yapılmaktadır. Bilindiği üzere beyin içerisinde hipokampüs hafızayla ilgili önemli bir yapılardan birisidir. Hipokampüs’de olan hacimsel değişiklikler ise başta Alzheimer ve demans olmak üzere klinikte oldukça önem arz etmektedir. Bunun dışında anatomi eğitiminde hipokampüs kısımlarının anlatılması ve şekiller ile açıklanması da zordur. Günümüzde farklı yazılımlar kullanılarak hipokampüs hacimleri ölçülmektedir. Bu yazılımların bazıları otomatik bazıları ise yarı otomatiktir. Bu kursta otomatik olarak kullanılan ve bilimsel geçerliliği tüm dünyada kabul görmüş Volbrain/HIPS kullanılarak hipokampüs kısımlarının parselasyon haritaları elde edilecektir. Volbrain web adresine (https://www.volbrain.net/) girilerek önce kayıt oluşturulacaktır. VolBrain, MR T1 görüntülerinin yüklendiği ve sonuçların birkaç dakika sonra elde edildiği ücretsiz bir bulut sistemidir. MR T1 datasını volbraine yüklemeden önce Mr cihazından alınan DICOM görüntüler mricron ile sıkıştırılmış niftii (gz) formatına çevrilmesi ve tek bir dosya oluşturması da gösterilecektir.

Volbrain’den indirilen sonuçlar ITKSnap ile üç boyutlu görüntülenecek ve kayıt edilecektir. Aynı zamanda burdan STL formatında kayıt edilen üç boyutlu STL formatındaki dosyalar direk üç boyutlu yazıcılardan da çıktı alınabilmektedir.  Kursa katılan katılımcılar volbrain sistemi ile dosyalarını yükleyecek, hacim sonuçlarını elde edecek ve ITKSnap ile de üç boyutlu görüntüleyebileceklerdir. Konu ile ilgili bu sistem kullanılarak beyinle ilgili tüm hastalıklarda hipokampüs hacimlerinin değişip değişmediğini göstermek için tez, yayın ve proje yapılabilir.

Kurs Sonunda Neler Öğrenilecektir?
1.Hipokampüs ve sağ ve sol kısımlarının hacimleri elde edilecek ve yorumlanacaktır. 
2.Yapılar ITKsnap ile üç boyutlu modellenecektir
3.Üç boyutlu yazıcı için dosyaların kayıt edilmesi gösterilecektir.

Kullanılanacak Programlar
1.ITKSnap  http://www.itksnap.org/pmwiki/pmwiki.php?n=Downloads.SNAP4 
2.Mricon https://www.nitrc.org/projects/mricron/ 
3.mricroGL

Önemli Not!: Her katılımcı kendi laptopu ile gelecek (tercihen Windows tabanlı, en az 4 GB Ram ve en az i3 işlemci, 2 GB boş disk alanı), kurs günü kurstan yarım saat önce kurs ekibi tarafından katılımcılara ITKSnap programı kurulacaktır. 

*Kursu başarı ile tamamlayan kursiyerler kurs katılım belgesi almaya hak kazanacaklardır.